La enfermedad de Crohn es un proceso inflamatorio crónico del tracto intestinal principalmente. Aunque puede afectar a cualquier parte del tubo digestivo desde la boca hasta el ano, afecta con más frecuencia a la porción más baja del intestino delgado (íleon) o al intestino grueso (colon y recto). La EC es una afección crónica y puede volver a aparecer varias veces durante la vida. Algunas personas tienen periodos prolongados de remisión, a veces durante años, en los que no presentan síntomas. No hay manera de predecir cuándo puede ocurrir una recaída ni cuándo volverán a aparecer los síntomas.

Debido a que la EC puede afectar a cualquier parte del intestino, los síntomas pueden ser muy distintos entre un paciente y otro. Entre los síntomas frecuentes se encuentran los cólicos, el dolor abdominal, la diarrea, la fiebre, la pérdida de peso y la inflamación. No todos los pacientes presentan todos estos síntomas, y algunos no muestran ninguno de ellos.